Семейство представляет небольшую многообразную группу протистов, имеющую несомненное близкое родство с перидинеями и, возможно, отдаленное с некоторыми грибами, например, сапролегниевыми. Оно объединяет преимущественно эктопаразитов морских ракообразных зоопланктона, хотя в его состав входят и эпибионты (некоторые виды Ellobiocystis), паразиты пресноводных копепод и кладоцер, а также непелагических Polychaeta (Bridgemanetal., 2000). Согласно последним данным по таксономии эллобиопсид, семейство Ellobiopsidae объединяет 5 родов, 4 из которых (Ellobiocystis, Parallobiopsis, Ellobiopsis, Thalassomyces) преимущественно эктопаразиты пелагических ракообразных и один монотипичный род Rhizellobiopsis, паразитирующий на бентосном многощетинковом черве (Shields, 1994). Дифференциация родов внутри семейства осуществляется по наличию или отсутствию органов прикрепления, а также по числу и форме трофомеров и гономеров.
В Японском море найдены представители рода Ellobiopsis.